Jos Raaijmakers
Hoogleraar Microbiële interacties en diversiteit
- Naam
- Prof.dr. J.M. Raaijmakers
- Telefoon
- 071 5272727
- j.raaijmakers@nioo.knaw.nl
- ORCID iD
- 0000-0003-1608-6614
Voor meer informatie, zie Engelse versie.
Nieuws
-
Software die de analyse van bacterie-genomen veel eenvoudiger maakt -
Jos Raaijmakers nieuw lid KHMW: ‘Brug slaan tussen wetenschap en maatschappij’ -
Twee Leidse hoogleraren gekozen als KNAW-leden -
Wat Darwin niet kon zien: Expeditie gaat op zoek naar onzichtbaar leven op Galapagos -
Jos Raaijmakers genomineerd voor Huibregtsenprijs 2022 -
Slapende antibiotica wakker maken met ERC Advanced beurs -
Deze elf Leidse bètaonderzoekers behoren tot de meest geciteerden ter wereld -
Microben beschermen gewassen tegen microben -
IBL coördineert project voor nieuwe medicijnen uit biodiversiteit van de zee
-
ENW-Groot-subsidies voor Leidse bètawetenschappers -
Leidse biologie gewaardeerd met grote NWO-beurzen -
Bacteriën in plantenwortels bestrijden schimmelziekte -
Zwaartekrachtsubsidie: ruim twintig miljoen voor duurzame gewassen -
Gezocht: bacteriën die planten doen floreren -
Forse investering voor gewasbescherming door microben
Hoogleraar Microbiële interacties en diversiteit
- Wiskunde en Natuurwetenschappen
- Instituut Biologie Leiden
- IBL Microbial Sciences
- Guerrero Egio G., Pintado A., Bretscher K.M., Arias-Giraldo L.M., Paulson J.N., Spaink H.P., Claessen D., Ramos C., Cazorla F.M., Medema M.H., Raaijmakers J.M. & Carrion Bravo V.J. (2024), bacLIFE: a user-friendly computational workflow for genome analysis and prediction of lifestyle-associated genes in bacteria, Nature Communications 15: 2072.
- Meij A. van der, Elsayed S.S.M.A., Willemse J.J., Du C., Wood T.M., Martin N.I., Raaijmakers J.M. & Wezel G.P. van (2023), The plant stress hormone jasmonic acid evokes defensive responses in streptomycetes, 89(11): e01239-23.
- Oyserman B.O., Flores S.S., Griffioen T., Pan X., Wijk E. van der, Pronk L., Lokhorst W., Nurfikari A., Paulson J.N., Movassagh M., Stopnisek N., Kupczok A., Cordovez V., Carrión V.J., Ligterink W., Snoek B.L., Medema M.H. & Raaijmakers J.M. (2022), Disentangling the genetic basis of rhizosphere microbiome assembly in tomato, Nature Communications 13: 3228.
- Tracanna V., Ossowicki A., Petrus M.L.C., Overduin S., Terlouw B.R., Lund G., Robinson S.L., Warris S., Schijlen E.G.W.M., Wezel G.P. van, Raaijmakers J.M., Garbeva P. & Medema M.H. (2021), Dissecting disease-suppressive rhizosphere microbiomes by functional amplicon sequencing and 10× metagenomics, mSystems 6(3): e01116.
- Ossowicki A., Raaijmakers J.M. & Garbeva P. (2021), Disentangling soil microbiome functions by perturbation, Environmental Microbiology Reports 13(5): 582-590.
- Avalos M., Garbeva P., Raaijmakers J.M. & Wezel G.P. van (2020), Production of ammonia as a low-cost and long-distance antibiotic strategy by Streptomyces species, The ISME Journal 14(2): 569-583.
- Masteling Pereira R., Voorhoeve L., IJsselmuiden J., Dini-Andreote F., Boer W. de & Raaijmakers J.M. (2020), DiSCount: computer vision for automated quantification of Striga seed germination, Plant Methods 16(1): 60.
- Masteling Pereira R., Voorhoeve L., IJsselmuiden J., Dini-Andreote F., Boer W. de & Raaijmakers J.M. (2020), DiSCount: computer vision for automated quantification of Striga seed germination, Plant Methods 16(1): 60.
- Carrión V.J., Perez-Jaramillo J., Cordovez V., Tracanna V., Hollander M. de, Ruiz-Buck D., Mendes L.W., Ijcken W.F.J. van, Gomez-Exposito R., Elsayed S.S., Mohanraju P., Arifah A., Oost J. van der, Paulson J.N., Mendes R., Wezel G.P. van, Medema M.H. & Raaijmakers J.M. (2019), Pathogen-induced activation of disease-suppressive functions in the endophytic root microbiome, Science 366(6465): 606-612.
- Masteling Pereira R., Lombard L., Boerr W. de, Raaijmakers J.M. & Dini-Andreote F. (2019), Harnessing the microbiome to control plant parasitic weeds, Current Opinion in Microbiology 49: 26-33.
- Avalos Garcia M., Wezel G.P. van, Raaijmakers J.M. & Garbeva P. (2018), Healthy scents: microbial volatiles as new frontier in antibiotic research?, Current Opinion in Microbiology 45: 84-91.
- Meij A. van der, Willemse J.J., Schneijderberg M.A., Geurts R., Raaijmakers J.M. & Wezel G.P. van (2018), Inter- and intracellular colonization of Arabidopsis roots by endophytic actinobacteria and the impact of plant hormones on their antimicrobial activity, Antonie van Leeuwenhoek 111(5): 679-690.
- Ma H., Pineda A., Wurff A.W.G. van der, Raaijmakers J.M. & Bezemer T.M. (2017), Plant-soil feedback effects on growth, defense and susceptibility to a soil-borne disease in a cut flower crop: species and functional group effects, Frontiers in Plant Science 8: 2127.
- Voort M. van der, Kempenaar M., Driel M. van, Raaijmakers J.M. & Mendes R. (2016), Impact of soil heat on reassembly of bacterial communities in the rhizosphere microbiome and plant disease suppression, Ecology Letters 19(4): 375-382.
- Cheng X., Cordovez V., Etalo D.W., Voort M. van der & Raaijmakers J.M. (2016), Role of the GacS Sensor Kinase in the Regulation of Volatile Production by Plant Growth-Promoting Pseudomonas fluorescens SBW25, Frontiers in Plant Science 7: 1706.
- Perez-Jaramillo J.E., Mendes R. & Raaijmakers J.M. (2016), Impact of plant domestication on rhizosphere microbiome assembly and functions, Plant Molecular Biology 90(6): 635-644.
- Raaijmakers J.M. & Mazzola M. (2016), Soil immune responses Soil microbiomes may be harnessed for plant health, Science 352(6292): 1392-1393.
- Weisskopf L., Ryu C.M., Raaijmakers J.M. & Garbeva P. (2016), Smelly Fumes: Volatile-Mediated Communication between Bacteria and Other Organisms, Frontiers in Microbiology 7: 2031.
- Liu Y., Zachow C., Raaijmakers J.M. & Bruijn I. de (2016), Elucidating the Diversity of Aquatic Microdochium and Trichoderma Species and Their Activity against the Fish Pathogen Saprolegnia diclina, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 17(1): 140.
- Song C., Kidarsa T.A., Mortel J.E. van de, Loper J.E. & Raaijmakers J.M. (2016), Living on the edge: emergence of spontaneous gac mutations in Pseudomonas protegens during swarming motility, Environmental Microbiology 18(10): 3453-3465.
- Cordovez V., Carrion V.J.J., Etalo D.W., Mumm R., Zhu H., Wezel G.P. van & Raaijmakers J.M. (2015), Diversity and functions of volatile organic compounds produced by Streptomyces from a disease-suppressive soil, Frontiers in Microbiology 6: 1081.
- Hoofd onderzoeksafdeling